Uno de los problemas más comunes a la hora de conectarnos desde el exterior a nuestro "ownCloud" que previamente hemos instalado en "FreeNAS", es que ownCloud detecte que estamos accediendo desde un dominio no confiable y nos salga el siguiente mensaje:

You are accessing the server from an untrusted domain.
Please contact your administrator.If you are an administrator of this instance, configure the "trusted_domains"
setting in config/config.php. An example configuration is provided in config/config.sample.php.
Depending on your configuration, as an administrator you might also be able to use the button below to trust this domain.

Tal como dice la solución al problema está en configurar el fichero "config.php".  Para ello vamos a seguir los siguientes pasos:

1.-Entramos en el panel de administración de "FreeNAS"
2.-Abrimos la terminal en : Jail>Shell
3.-Accedemos a la ruta de nuestro "ownCloud": 

[root@freenas ~]#  cd /mnt/(nombre de tu host)/jails/owncloud_1/usr/pbi/owncloud-amd64/www/owncloud/config/

4.-Editaremos el fichero config.php:  [root@freenas ~]# nano config.php

En nuestro ejemplo tenemos ownCloud en la ip local 192.168.1.3 y estamos accediendo desde la ip pública: 136.47.29.178 por lo que añadiremos la ip a "trusted domains"

Esta parte del script la editamos:
"trusted_domains" =>                                                          
  array (                                                                       
    0 => "192.168.1.3"                                      
  ),

y lo cambiaremos por esto:

"trusted_domains" =>                                                          
  array (                                                                       
    0 => "192.168.1.3","136.47.29.178"                                          
  ),

SCRIPT COMPLETO:

$CONFIG = array (                                                               
  "memcache.local" => "OCMemcacheAPCu",                                   
  "htaccess.RewriteBase" => "/",                                                
  "instanceid" => "oc3bj2nfqo4e",                                               
  "passwordsalt" => "Y6USB48K2p15WE+Avs7hnX13WpVh7C",                           
  "secret" => "rySgo2Vc03oNCD/ZYowCrK6rKHFsXVDwOzCa1xbOQtMyKTzX",               
  "trusted_domains" =>                                                          
  array (                                                                       
    0 => "192.168.1.3","136.47.29.178"                                          
  ),                                                                            
  "datadirectory" => "/media",                                                  
  "overwrite.cli.url" => "https://192.168.1.3",                                  
  "dbtype" => "sqlite3",                                                        
  "version" => "9.1.2.5",                                                       
  "logtimezone" => "UTC",                                                       
  "installed" => true,                                                          
);

Pulsamos ctrl+o para sobrescribir el fichero y  ya podemos acceder sin problemas a nuestro ownCloud